Petct'de kullanılan radyoaktif madde flor 18 ile işaretlenmiş glikozdur.Glikoz bildiğimiz şeker olduğu için vücuda herhangi bir şekilde yabancı bir madde değildir.Ve dolayısıyla hiç bir yan etkisi yoktur.Radyoaktif flor 18'in ise Dünya çapında bildirilmiş bir yan etkisi bulunmamakta.Petct sırasında aynı anda bilgisayarlı tomografi çekimi elde edilmekte ve bu bilgisayarlı tomografi çekimi normal tanısal tomografilerden farklı bir yöntem.
Pet CT sırasında çekilen bilgisayarlı tomografi çok düşük dozda sadece Positron emission tomografisinde yani pet görüntülerinde ki elde edilen imajların organ lokalizasyonunu belirlemede kullanılan tanısal amaçlı olmayan düşük doz bir tomografi yöntemi olduğu için oldukça düşük miktarda radyasyon alınmakta.Doktor kontrolünde ve belli sıklıklarla yapıldığı müddetçe petct'nin yarar zarar oranıda değerlendirildiğinde hastaya zararı yoktur aksine faydası vardır.